전남지역 코로나19 변이바이러스 유전자형 분석 연구: 2021년 7월～11월

윤연희, 이연주, 최수정, 임형우, 나혜영, 임현철, 안양준

감염병조사1과

A Study of Genetic Analysis of the COVID-19 Variant Virus in Jeollanam-do: From July to November 2021

Y. H. Yoon, Y. J. Lee, S. J. Choi, H. W. Lim, H. Y. Na,

H. C. Lim, Y. J. An

Infectious Disease Research 1st Division

Abstract

As the coronavirus disease-19(Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2, SARS-CoV-2, COVID-19), which occurred in December 2019, has spread worldwide, variant viruses such as Alpha, Beta, Gamma, and Delta are continuously emerging. In particular, the delta variant originating in India is rapidly transferring between countries, and the delta variant virus is also spreading in Korea. In most cases of COVID-19, a real-time polymerase chain reaction test is performed as a diagnostic test for screening and confirmation. From July 13 to November 2, 2021, genetic mutations were confirmed in 418 samples which had been confirmed positive for COVID-19 in Jeollanam-do. As a result of conducting PCR analyses on positive samples of confirmed cases related to local infection and overseas imports, a total of 378 variants of concern(VOC)(Delta 377, Alpha 1) were confirmed in Jeollanam-do. Regarding domestic infection, Delta became the dominant variant with a detection rate of 99.7 % in Jeollanam-do from November 2 and to July 13, 2021. The aim of this study was to provide information on the genotype results of the COVID-19 virus occurring in Jeollanam-do in order to help establish measures to prevent the emergence of new SARS-CoV-2 variants and the spread of infections in the community.

Keywords: Coronavirus Disease-19(COVID-19), Alpha, Delta, Variant of Concern(VOC), Variant of Interest(VOI)

2021년 7월 13일부터 11월 2일까지 전라남도 내에서 코로나19바이러스로 검출 확인된 총 418건의 검체에 대한 유전형과 변이 유무를 확인한 결과는 다음과 같다.

1.  전남지역 감염 및 해외유입 감염자의 양성 검체 총 418건에 대한 스파이크(S) 단백질을 타겟으로 하는 유전자 분석을 실시한 결과, 주요 변이바이러스는 양성 검체건수 대비 378건(90.4 %)이 확인되었고, 그 중 델타 변이는 377건(99.7 %), 알파 변이 1건(0.3 %) 순으로 확인되었다. 반면에 베타와 감마 변이는 확인되지 않았다.

2.  코로나19 변이 바이러스 분류 결과, 주요 변이 바이러스(VOC) 378건(90.4 %), 기타 변이 바이러스(VOI)는 20건(4.8 %)로 검출 확인되었다.

3.  시험대상 검체의 성별은 남자 245건, 여자 173건으로 남자가 많았으며, 남자(245건)는 알파 1, 델타 218, 기타변이 17, 변이불검출 9건이 검출 확인되었고, 여자(173건)는 델타 159, 기타변이 3, 변이불검출 11건으로 검출 확인되었다.

4.  시험대상 검체의 감염경로는 지역사회 감염이 391건(94 %), 해외유입이 27건(6 %)이었으며, 지역사회 감염 391건 중 351건이 델타 변이로 90.0 %의 우세한 변이형임을 나타내었고, 해외유입 감염사례의 경우 27건 모두에서 델타 변이로 검출 확인되었다.

본 연구에서 특정시기(2021. 7. 13.~11. 2.)에 확인된 코로나19 바이러스의 변이 유전자형은 델타 변이가 우세종임을 알 수 있었고, 향후 기타 변이 바이러스(VOI) 또는 신규 변이 바이러스 출현과 확산에 대응하기 위하여 전장유전체분석을 통한 코로나19 변이 바이러스의 출현 감시 및 유전적 특성 분석 등 추가적인 연구가 필요할 것으로 판단된다.